Chaenothecopsis debilis tipicamente abita la corteccia e il legno, prosperando in ambienti dove può formare relazioni simbiotiche con specie algali. Questa specie fa parte di un gruppo che comprende funghi molto piccoli, spesso trascurati, i quali si concentrano principalmente sulla decomposizione del materiale organico, contribuendo in modo significativo ai loro ecosistemi con il riciclo dei nutrienti.
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