Los cuerpos frutales de Gymnopilus cyanopalmicola tienen tapas amarillas, convexas a planas de 5 a 10 cm de diámetro, con escamas fibrilosas que son erectas cerca del centro y apresadas cerca del margen. Las láminas son abarrotadas, ventricosas, con fijación adnata a decurrente. El tallo mide de 40 a 210 mm de largo por 4 a 21 mm de diámetro, cilíndrico, fibriloso, con forma cónica en la base en cuerpos frutales más grandes. Es de color blanco amarillento y se vuelve morado, rojo oscuro o marrón oscuro cuando se magulla o se seca. El estipe tiene un anillo membranoso amarillo blanquecino conspicuo pero que pronto desaparece. La trama del píleo es de color amarillo claro, similar al color de la tapa. El olor es fúngico. Las esporas verrugosas son elipsoidales a oblongas, amigdaliformes, con paredes gruesas, sin poro ni plaga germinal, pero con una depresión superhilar. Típicamente miden de 8.0 a 8.8 (-11.2) x 5-6 (6 - 8) μm. Son dextrinoides, de color marrón anaranjado en KOH, no metacromáticas y tienen ornamentación cianofílica. Las basidios son transparentes a amarillentas, tetraspóricas, de 26.4 - 37.5 x 6.4 - 7.7 μm, cilíndricas a clavadas, constreñidas en el medio, con esterigmas de 3.2–4.8 μm de largo. Las bases de las basidios tienen conexiones de abrazadera. Las cistidias en el borde de la lámina (quelocistidias) son transparentes a amarillentas, a veces con contenido granuloso amarillo marrón, estrechamente lageniformes con un ápice subcapitado a capitado, y tienen dimensiones de 21.6–28 × 6.4–7.6 μm, con un ápice de 4.8–7.2 μm. La base de las quelocistidias tiene conexiones de abrazadera. Las pleurocistidias (cistidias en la cara de la lámina) son extremadamente raras. Cuando están presentes son transparentes a amarillentas, utriformes, de 21.6–26 × 7 μm, con un ápice obtuso a subcapitado que tiene un diámetro de 3.4–5.6 μm. La trama himenoforal es subparalela, clara a amarillenta, con hifas de 3.4 a 14.7 μm de diámetro y muchas gotas refractivas. El subhimeno es celular y transparente, con algunos elementos inflados alargados. La trama del píleo es amarillenta a marronácea, radial, con zonas entrelazadas cerca de la pilipelis, y tiene hifas de 4.8 - 8.7 μm de diámetro, con paredes de 0.5 a 2.5 μm. La cutícula de la tapa es una cutícula con hifas prostáticas. Las escamas son un tricodermo con hifas septadas de 7.2 a 23.5 μm de diámetro, con conexiones de abrazadera y pigmento marrón amarillento incrustado en bandas. Las pileocistidas están ausentes. Las caulocistidias son estrechamente lageniformes a estrechamente utriformes, de 31 a 44 x 5.6 a 11 μm, con un ápice capitado a subcapitado de 3 a 7 μm.