Chaenothecopsis debilis típicamente habita en la corteza y la madera, prosperando en entornos donde puede formar relaciones simbióticas con especies de algas. Esta especie es parte de un grupo que incluye hongos muy pequeños, a menudo pasados por alto, que se centran principalmente en descomponer material orgánico, contribuyendo significativamente a sus ecosistemas mediante el reciclaje de nutrientes.
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