Arthopyrenia cinereopruinosa crece principalmente en la corteza de los árboles y en superficies de madera expuesta, prosperando en entornos donde tales sustratos están presentes. Su apariencia puede mezclarse suavemente con la corteza, a menudo haciéndolo pasar desapercibido para el observador casual. Arthopyrenia cinereopruinosa contribuye al ecosistema participando en el proceso de descomposición y apoyando la complejidad del hábitat.
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